Mato Kuroi adalah siswi pelajar SMP yang baru memulai kehidupan sekolahnya. Seperti kehidupan orang normal lainnya, mato ingin mencari teman-teman disekolahnya. Ketika ia ingin bergaul dengan Yomi Takanashi, ternyata siswi yang satu ini merupakan orang yang tertutup.
Meski begitu, Mato tidak menyerah begitu saja, secara bertahap pertemanan mereka mulai terlihat.
Ternyata seorang gadis lumpuh bernama Kagari Izuriha tidak menyukai pertemanan mereka. Kagari yang dari dulu terobsesi dengan Yomi terus mencegah Mato untuk mendekati dia.
Sementara didunia lain, gadis bernama Black☆Rock Shooter sedang bertempur dengan Chariot.
Dan ketika Black☆Rock Shooter menang melawan Chariot, entah mengapa secara tidak terduga berdampak di dunia nyata. Mato seperti “mengalahkan” Kagari ketika di Rumah sakit.
Hal ini mengakibatkan Obsesi Kagari terhadap Yomi menghilang.
Yomi dan Mato merasa terbebaskan oleh kekangan Kagari, persahabatan diantara mereka berdua pun mulai terjalin.
Teman kecil Mato yang bernama Yuu Koutari merasa cemburu ketika melihat keakraban antara Mato dan Yomi. Sementara di dunia lain, Black☆Rock Shooter telah ditunggu dengan lawan baru bernama Black☆Gold Saw.